生殖内分泌不孕中心是医院重点科室之一，广州医科大学附属第三医院不孕不育专科技术联盟单位，设立有女科门诊、男科门诊、中医门诊、超声检查室、不孕不育相关项目检测实验室等。
    中心现有专业技术人员15人，其中主任医师5人，主治医师4人、实验室人员2人，超声人员2人、护理人员2人。中心配备高清腹腔镜、宫腔镜；进口彩色超声诊断设备；GE数值化X线摄影系统；贝尔曼全自动生化分析仪；精液分析系统；染色体自动分析系统等先进设备。

    专科特色：
    女性不孕专科：主攻不孕不育各种病因诊断与诊疗，包括月经周期激素调控、促排卵药物临床应用、诱发排卵（OI）及控制性超促排卵（CHO）方案选择和黄体支持治疗；复发性流产的规范化诊疗；先兆流产的保胎治疗；各种生殖道畸形矫正手术；各种生殖内分泌疾病的诊治；同时开展辅助生殖技术（ART）之前的各项检查服务；并有绿色转诊通道至联盟医院进行辅助生殖技术服务。开展不孕不育的宫腔镜、腹腔镜相关手术；开展周期卵泡监测等；开展X线下子宫输卵管造影及实时三维子宫输卵管超声造影+宫腔造影等
    男性不育专科：开展男性性功能障碍、男性不育症（弱精、少精、无精等）、前列腺疾病、阴茎疾病、阴囊睾丸疾病、附睾疾病及男性性传播疾病的诊治。
    实验室：开展外周血染色体、精液细胞学、精子功能、生殖免疫、生殖内分泌、细胞遗传学、微生物、睾丸功能评估等不孕不育相关项目检查。