新生儿科肩负全市危重新生儿护理抢救工作。是清远市临床重点专科；广东省危重新生儿护理抢救分中心，清远市青年文明号。学科带头人李伟明为儿科主任医师，暨南大学儿科硕士导师，医学院校兼职教授，享受国务院特殊津贴专家，市技术拨尖人才。科室规模及技术水平处于全市领先水平，年收治病人2000余人次，治愈率达95%以上。

妇科是医院重点专科特色之一，是广东省"巾帼文明示范岗"、清远市"南粤女职工文明示范岗"。学科带头人为广东省医学会保健分会常务委员，清远医学会妇产科分会副主任委员。技术力量雄厚，设备先进，每年收治患者 3100多人次、门诊量10多万人次。

儿科是清远市临床重点专科，设置160张病床，技术力量雄厚，设备先进，每年收治患儿1万人次以上，为全市各大医院之首。危重病人抢救成功率98.05%。

产科是清远市妇幼保健院产科历史悠久，技术力量雄厚，是清远市规模最大的产科之一。临床重点专科，集预防、保健、治疗、康复、科研、教学于一体的重点科室。学科带头人为广东省医学会保健分会常务委员，清远医学会妇产科分会副主任委员。年收治产妇4600多人次，危、急、重症的抢救治疗及新生儿复苏、早产儿的抢救成功率处于领先地位。急危重病人抢救成功率100%。

妇女、儿童保健中心是医院特色专科之一，开设专科有儿童保健、妇女保健、婚前保健、体验中心。现有医务人员17人，其中副主任医师2人、主治医师3人、副主任护师1人、主管护师2人等。

清远市妇幼保健院?妇女儿童医院中医科创建于2004年，是集医、教、研、预防、保健、康复于一体的一级科室，现有医务人员8人，其中主任医师1人，主治医师1人，中医师3人，康复治疗师1人，医师2人。内设中医、针灸、推拿、康复、中医妇儿、不孕不育门诊，有超短波治疗仪、微波治疗仪、红外线治疗仪、中频脉冲电治疗仪、导入治疗仪等仪器设备十多台（套），年平均门诊量3万人次，年均康复理疗2.7万人次。

小儿神经康复科是清远市妇幼保健院特色专科之一。聘请享受国务院特殊津贴、卫生部首批突出贡献的中青年医学专家、国际知名的儿童康复专家刘振寰教授为名誉主任，每月定期2天到我科查房及医生和治疗师培训。曾派送多人到广州市儿童医院进修。技术精良，有丰富的康复治疗经验，深受患儿家长好评。